Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms