Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms