Protein–RNA interactions for Protein: Q99259

GAD1, Glutamate decarboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAD1Q99259 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GAD1Q99259 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GAD1Q99259 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms