Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms