Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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SUSD3Q96L08 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD3Q96L08 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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