Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms