Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TTC29Q8NA56 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TTC29Q8NA56 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TTC29Q8NA56 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC29Q8NA56 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TTC29Q8NA56 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TTC29Q8NA56 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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