Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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