Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RASSF3Q86WH2 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms