Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CATSPER4Q7RTX7 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms