Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms