Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR156-202ENST00000461057 2525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 GCC2-201ENST00000309863 7537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF10-203ENST00000398560 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 IVD-203ENST00000479013 4251 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 INTS6L-206ENST00000639893 3904 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 AC010997.4-201ENST00000609200 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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COL5A1-AS1Q5SY13 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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COL5A1-AS1Q5SY13 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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COL5A1-AS1Q5SY13 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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COL5A1-AS1Q5SY13 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 LGALS8-208ENST00000416919 6097 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 CUL5-201ENST00000393094 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COL5A1-AS1Q5SY13 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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