Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms