Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC27A3Q5K4L6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms