Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms