Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RGL4-210ENST00000615003 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ATP2A1-201ENST00000357084 3532 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SNAP25-202ENST00000304886 2050 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 OSBPL6-206ENST00000409045 3427 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SLC8A3-207ENST00000528359 2840 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PRLR-211ENST00000511486 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SEPT10-201ENST00000356688 3091 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ZNF133-215ENST00000630056 1999 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MAN1C1-202ENST00000374329 2461 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PDE4C-206ENST00000594465 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms