Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms