Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms