Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MSMPQ1L6U9 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms