Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF56Q15929 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms