Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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VPS72Q15906 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
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VPS72Q15906 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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