Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SKIV2LQ15477 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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SKIV2LQ15477 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SKIV2LQ15477 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SKIV2LQ15477 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SKIV2LQ15477 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SKIV2LQ15477 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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