Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms