Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms