Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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GTF2H3Q13889 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
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GTF2H3Q13889 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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GTF2H3Q13889 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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GTF2H3Q13889 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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