Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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NCOA4Q13772 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCOA4Q13772 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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