Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL4BQ13620 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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