Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTMR3Q13615 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTMR3Q13615 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms