Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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PMS2P3Q13401 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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PMS2P3Q13401 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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