Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms