Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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