Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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