Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFRD2Q12894 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFRD2Q12894 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms