Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHD3Q12873 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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CHD3Q12873 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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CHD3Q12873 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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CHD3Q12873 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
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CHD3Q12873 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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CHD3Q12873 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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