Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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