Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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SYCNQ0VAF6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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SYCNQ0VAF6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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SYCNQ0VAF6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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