Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms