Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX1P78337 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms