Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RPS29P62273 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
RPS29P62273 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RPS29P62273 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RPS29P62273 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RPS29P62273 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RPS29P62273 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RPS29P62273 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RPS29P62273 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
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