Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP98P52948 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP98P52948 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP98P52948 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP98P52948 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP98P52948 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP98P52948 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP98P52948 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP98P52948 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP98P52948 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP98P52948 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP98P52948 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP98P52948 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP98P52948 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP98P52948 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP98P52948 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP98P52948 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP98P52948 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP98P52948 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP98P52948 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP98P52948 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP98P52948 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP98P52948 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP98P52948 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP98P52948 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP98P52948 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms