Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms