Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NMUP48645 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NMUP48645 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NMUP48645 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NMUP48645 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NMUP48645 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NMUP48645 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NMUP48645 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NMUP48645 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NMUP48645 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NMUP48645 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NMUP48645 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NMUP48645 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NMUP48645 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NMUP48645 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NMUP48645 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NMUP48645 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NMUP48645 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NMUP48645 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NMUP48645 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms