Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARCN1P48444 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARCN1P48444 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARCN1P48444 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARCN1P48444 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARCN1P48444 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARCN1P48444 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARCN1P48444 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARCN1P48444 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARCN1P48444 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARCN1P48444 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARCN1P48444 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARCN1P48444 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARCN1P48444 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARCN1P48444 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARCN1P48444 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARCN1P48444 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARCN1P48444 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARCN1P48444 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARCN1P48444 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARCN1P48444 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms