Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms