Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETFBP38117 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETFBP38117 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETFBP38117 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETFBP38117 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETFBP38117 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ETFBP38117 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETFBP38117 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETFBP38117 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETFBP38117 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETFBP38117 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETFBP38117 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETFBP38117 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ETFBP38117 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETFBP38117 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETFBP38117 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETFBP38117 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms