Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms