Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms