Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms