Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 AC093915.1-201ENST00000605740 1543 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 GP6-203ENST00000417454 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms