Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms